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♦ RESEARCH ♦

WunschLab
I am appointed professor of biochemistry and molecular biology at the University of Applied Sciences Mittweida. Here I work there with my research group, nicked WunschAG. As Dean of Studies, I am responsible for the bachelor's degree programme in biotechnology and the master's degree programme in genomic biotechnology. Interested? Study Biotechnology
An der Hochschule Mittweida bin ich als Professor für Biochemie und Molekularbiologie berufen. Dort arbeite ich mit meiner Forschungsgruppe, der WunschAG. Als Studiendekan verantworte ich zudem den Bachlelorstudiengang Biotechnologie und den Masterstudiengang Genomische Biotechnologie. Interesse? Studiere Biotechnologie!
BioData, Biogas, Bees & more
In my research group we apply experimental and computational methods that have sequence data in common. We derive these data mostly from (meta)transcriptomics and (meta)genomics in very diverse fields such as dog breeding, biodiversity research with bees, human pathogens and biohydrogen research.
In meiner Forschungsgruppe wenden wir experimentelle und rechnergestützte Methoden im Bereich der Molekulargenetik an. Die Daten stammen meist aus der (Meta-)Transkriptomik und (Meta-)Genomik aus sehr unterschiedlichen Bereichen wie der Hundezucht, Biodiversitätsforschung mit Bienen, menschlichen Krankheitserregern und der Biowasserstoffforschung.
Sheep-Poodle Genetics / Schafpudel Genetik [Infoseite]
The living sheep-poodle population in Germany has a size of around 800 individuals. This increases the risk of inbreeding effects. Together with breeders we try to identify potential hereditary diseases.
Die Schafpudel-Population in Deutschland besteht aus etwa 800 Individuen. Dies erhöht das Risiko von Inzuchteffekten. Gemeinsam mit Züchtern untersuchen wir ausgewählte Effekte.
   

♦ BOOKS ♦

Allgemeinbildung Gene, Genetik und Gentechnik für Dummies
Der Titel dieses Buches trägt das wunderbare Wort Allgemeinbildung. Und diese wiederum setzt Allgemeinwissen voraus. Ich unternehme den Versuch, aus Wissen ein Bild entstehen zu lassen. Dieses soll sich vor Ihrem geistigen Auge entfalten und Ihnen dabei helfen, durch die Untiefen, Strömungen und traumhafte Archipele der Genetik, Gentechnik und den zugrundeliegenden Genen zu navigieren. Dieses Buch ist daher kein typisches Fach- oder Sachbuch. Dennoch soll es Sie in ein Fachgebiet einführen. Ich wage es, Ihnen unter anderem neueste Erkenntnisse zur Vererbung, Methoden der Gentechnik und Theorien zur Evolution des Menschen vorzustellen. Mehr Information.
Genes, Genomes and Society – From Farming to Gene Editing and Beyond
With CRISPR/Cas gene editing tools in hand, we are currently experiencing a new dimension in genetic engineering. But where should the journey lead? Should we treat diseases or better repair them genetically? Will the new genetic engineering, combined with modern reproductive biology, lead to designer babies? And: May we allow a liberalization of these techniques as citizen science? This book is a translation of the original German 1st edition Generation Gen-Schere. More information.
Generation Gen-Schere – Wie begegnen wir der gentechnologischen Revolution?
Wir erleben derzeit eine neue Dimension der Gentechnik, doch wohin soll die Reise führen? Sollen wir Krankheiten therapieren oder besser genetisch reparieren? Führt die neue Gentechnik verbunden mit der modernen Reproduktionsbiologie zu Designer-Babies? Und: Dürfen wir eine Liberalisierung dieser Techniken als Bürgerwissenschaft (Citizen Science) zulassen? Dieses Sachbuch für engagierte Leserinnen und Leser bietet methodische Grundlagen und Hintergrundinformationen und will einen Beitrag zu einer sachlichen Gentechnik-Debatte leisten. Weitere Informationen: hier
Gentechnik – Gene lesen, schreiben und editieren
In Gentechnik – Gene lesen, schreiben und editieren geht es um eine knappe Übersicht über die Anwendung der Gentechnologie. Das Büchlein soll als Einführung für eine zeitgemäße öffentliche Diskussion zur Gentechnologie dienen. Die Gentechnik betrifft uns alle in vielen Bereichen und wir müssen uns trauen bunter und weiter zu denken. Weitere Informationen: hier
Schnellkurs Bioinformatik für Anwender
Mein Schnellkurs für alle, die als Experimentalisten bioinformatisches Arbeiten lernen möchten. Weitere Informationen: hier
Book on Computational Biology
The website accompanying my book Computational Biology: A Practical Introduction to BioData Processing and Analysis with Linux, MySQL, and R (2nd Edition, Springer Verlag, ISBN 978-3-642-34748-1) can be found here.
The website for the 1st edition can be found here.
Chapters in Biochemical Pathways
This website accompanies my chapters in the book Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (John Wiley & Sons, Inc, ISBN 978-0-470-14684-2) that can be found here.
Chapter on Evolution
This website accompanies our chapter entitled "Von Lucys Gebeinen zum Genom des Neandertalers" in the book Evolutionsbiologie – Moderne Themen für den Unterricht (Spektrum Akademischer Verlag, ISBN 978-3-8274-2785-4) that can be found here.
   

♦ SCIENCE IN THE WEB ♦

Reading DNA at School
Deciphering, decoding or reading the DNA means all the same: the analysis of the sequence of the building blocks of DNA. Together with teachers we developed an experiment that combines in vitro transcription, cutting DNA with the CRISPR/Cas system and detection of the cutting site with Nanopore-based DNA sequencing. Since the bioinformatics necessary to analyse the generated data is not that easy, I developed a website that does this job.
CyanoDesign
CyanoDesign is a tool for metabolic modelling and flux-balance analysis with a simple graphical user interface. It predicts the metabolic performance of cells under given intrinsic and extrinsic conditions. CyanoDesign is an integral part of the CyanoFactory KnowledgeBase. More information.
Nutrilyzer
Nutrilyzer is a software that extracts paralogous protein coding sequences from an annotated genome sequence and evaluates their atomic composition. When fed with gene-expression data for nutrient limited and normal conditions, Nutrilyzer provides a list of genes that are significantly differently expressed and contain significantly different amounts of the limited nutrient in their atomic composition. Its intended use is in the field of ecological stoichiometry.
PhyloAnnotator
A recent software tool for the visual annotation of phylogenetic trees is called PhyloAnnotator. Enjoy.
   

♦ INFO IN THE WEB ♦

CyanoFactory
CyanoFactory was a collaborate research project for design, construction and demonstration of solar biofuel production using novel synthetic cell factories. It brought together ten selected leading, highly complementary European partners with the aim to carry out integrated, fundamental research aiming at applying synthetic biology principles towards a cell factory notion in microbial biotechnology. The vision still remains to build on recent progress in synthetic biology and develop novel photosynthetic cyanobacteria as chassis to be used as self-sustained cell factories in generating a solar fuel.
Gene, Genome und Gesellschaft
Diese Seite begleitet meine 2019 erschienen Bücher zur Geneditierung und Gentechnik. Diese sollen als Einführung für eine zeitgemäße öffentliche Diskussion zur Gentechnologie dienen. Die Gentechnik betrifft uns alle in vielen Bereichen und wir müssen uns trauen bunter und weiter zu denken. Tatsächlich kann bereits das komplette Erbgut von Viren und Bakterien chemisch erzeugt und „zum Leben erweckt“ werden. Mit der Genchirurgie ist die Medizin an einem Scheidepunkt: Wollen wir Erbkrankheiten therapieren oder genetisch „reparieren“. Und die Analyse tausender menschlicher Erbgute fördert Informationen zutage, die mit komplexen Krankheiten aber auch Merkmalen wie Intelligenz in Verbindung stehen. Wie sollen wir dieses Wissen nutzen? Es stellt sich kaum noch die Frage, ob wir Gentechnik wollen, sondern vielmehr wie wir sie anwenden. Mehr Information.
Synthetic Biology
Here you find information about synthetic biology. This site had been create in context with the summer academy 2010 of the Studienstiftung des Deutschen Volkes. Not all content is visible for general users.
AWKology
AWKology is not a religion but the art performed by AWKolgists who process data with the scripting language AWK. I love it, I teach it and once in a while I do it. Look at my rudimentary blog.
Biohydrogen and Bioreactors
You are also welcome to take a look at my web project at www.biowasserstoff.de. With The Bioreactor Project I try to transfer the scientific knowledge about the biological photoproduction of hydrogen gas into the classroom. Thus, these educational pages are especially suited for teachers.